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A Euglena International Network (EIN), fundada em 2020, é um consórcio global de centenas de cientistas em todo o mundo com o objetivo coletivo de apoiar a ciência euglenoide por meio de ômicas colaborativas e integrativas entre acadêmicos e a indústria.
A EIN (https://euglenanetwork.org/) publicou hoje um documento de posição em Aberto de Biologiadestacando o caso de um esforço conjunto para gerar genomas de referência de alta qualidade para as quase 1.000 espécies conhecidas de euglenoides.
Os euglenóides fazem parte do grupo protista, lar de organismos eucarióticos que não se enquadram nos grupos de animais, plantas ou fungos. Esses diversos organismos unicelulares são encontrados em uma variedade excepcionalmente ampla de ecossistemas em todo o mundo.
Várias espécies de euglenoides têm aplicações translacionais, mostrando grande promessa na produção de biocombustíveis, nutracêuticos, biorremediação, tratamentos de câncer e até mesmo como simuladores de design robótico.
Seu enorme potencial tem sido amplamente inexplorado devido à falta de genomas de referência de alta qualidade.
Os genomas euglenoides apresentam um desafio particular de sequenciamento porque são um exemplo de endossimbiose secundária – abrigando mitocôndrias, cloroplastos e restos de material genético de organismos que eles envolveram para adquirir essas organelas.
Seu enorme potencial tem sido amplamente inexplorado devido à falta de genomas de referência de alta qualidade.
Os genomas euglenoides apresentam um desafio particular de sequenciamento porque são um exemplo de endossimbiose secundária – abrigando mitocôndrias, cloroplastos e restos de material genético de organismos que eles envolveram para adquirir essas organelas.
Como resultado, menos de 20 espécies foram exploradas em qualquer nível para o potencial translacional por meio da genômica. O EIN acredita que é o momento certo para abordar isso.
Através da geração de genomas de referência de alta qualidade para as espécies conhecidas de euglenoides, o EIN trabalhará para:
- Compreender a biologia básica dos euglenoides
- Entenda a evolução dos euglenoides
- Maximize as aplicações euglenoides na gestão ecológica e ambiental
- Explorar, traduzir e comercializar produtos euglenoides
Os dados coletados pelo EIN estarão disponíveis abertamente para a comunidade científica por meio do European Nucleotide Archive (ENA). Uma vez na ENA, os genomas anotados podem ser importados para recursos como o Ensembl Protists e apresentados de maneira uniforme e JUSTA para as comunidades de pesquisa.
A Dra. ThankGod Echezona Ebenezer, presidente fundadora da EIN e bioinformática do Instituto Europeu de Bioinformática (EMBL-EBI), Reino Unido, disse: “A Euglena International Network desempenhará um papel crucial ao ajudar a reunir especialistas em euglenoides para aumentar nossa compreensão de biologia dos euglenoides e suas aplicações translacionais. Isso pode ser útil para aprofundar nossa compreensão da evolução do parasitismo, jogos sociais, desenvolvimento de combustíveis para aviação ou apoio à exploração espacial humana.”
O professor Neil Hall, presidente do Comitê de Ciências da EIN e diretor do Earlham Institute, disse: “É incrivelmente raro encontrar um organismo tão versátil que tenha papéis potenciais na produção de alimentos, geração de biocombustíveis, engenharia robótica e desenvolvimento de medicamentos – e há Há muito mais aplicações possíveis. Produzir genomas de referência é o primeiro passo para entender esses organismos notáveis, para que possamos realizar seu potencial biotecnológico.”
O Dr. Masami Nakazawa, membro do Comitê Científico da EIN e professor sênior da Universidade Metropolitana de Osaka, no Japão, disse: “A EIN impulsionou as colaborações na comunidade euglenoide, onde já estou envolvido em projetos empolgantes relacionados ao metabolismo energético. Esclarecendo características inexploradas do euglenoides, incluindo informações genômicas, contribuirão para o bem-estar humano por meio da biotecnologia, além da ciência básica”.
A Dra. Anna Karnkowska, membro do Comitê Científico da EIN e Professora Assistente da Universidade de Varsóvia, Polônia, disse: “As características genômicas únicas e a presença de plastídeos secundários nos Euglenoides os tornam um grupo crucial para entender a evolução dos eucariotos e seus endossimbióticos organelas. Dados genômicos são essenciais para elucidar a história evolutiva dos euglenoides e projetar experimentos para explorar ainda mais sua biologia.”
O Dr. Eric W. Linton, membro do Comitê Científico da EIN, ex-presidente da Phycological Society of America (PSA) e professor da Central Michigan University, EUA, disse: “As informações genômicas que temos para os euglenóides mostram sua os genomas e as vias bioquímicas/metabólicas resultantes, em muitos casos, são compostos de genes de várias fontes, como bactérias, algas vermelhas e verdes. Essa quimera de um genoma pode nos dar insights raros sobre a evolução, organização e regulação do genoma.”
A Euglena International Network é uma rede afiliada ao Earth BioGenoma Project e à International Society of Protistologists.
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