Potencial diagnóstico do sequenciamento de RNA das células do líquido amniótico para decifrar doenças raras – Strong The One

As doenças raras são geralmente de origem genética. Embora individualmente raras, doenças coletivamente raras foram encontradas em 1 em 67 na população de Hong Kong, com base no estudo anterior da equipe. essenciais para apoiar os pacientes. As tecnologias atuais para diagnóstico pré-natal são em grande parte baseadas em DNA, com uma grande proporção (60-70%) permanece não diagnosticada, levando à incerteza clínica e ansiedade dos pais. Recentemente, descobriu-se que o sequenciamento de RNA aumenta o rendimento diagnóstico em 10% a 36%; no entanto, nenhum desses estudos se concentrou no diagnóstico pré-natal. Além disso, apesar da disponibilidade de um grande banco de dados bem estabelecido que cataloga o perfil de expressão gênica de diferentes tecidos para adultos, falta um conjunto de dados semelhante publicamente disponível para células do líquido amniótico que reflita o estágio embriológico e fetal. Mais estudos e pesquisas sobre o sequenciamento de RNA no cenário pré-natal são, portanto, necessários.

A equipe de pesquisa demonstrou a potencial utilidade clínica do sequenciamento de RNA das células do líquido amniótico. Uma linha de base para o perfil de expressão gênica de células do líquido amniótico é estabelecida pela realização de sequenciamento de RNA em mais de 50 amostras de líquido amniótico. O estabelecimento do perfil de expressão gênica é uma etapa essencial na aplicação do sequenciamento de RNA ao atual fluxo de trabalho de diagnóstico clínico selecionado. Eles descobriram que o número de genes bem expressos nas células do líquido amniótico era comparável a outros tecidos clinicamente acessíveis comumente usados ​​para diagnóstico genético em diferentes categorias de doenças. A equipe de pesquisa também comparou dados de sequenciamento de RNA de quatro fetos afetados com anomalias congênitas estruturais com a linha de base estabelecida para detectar possíveis outliers. Em colaboração com a Universidade Técnica de Munique, na Alemanha, um pipeline de bioinformática foi adaptado para aprimorar a detecção de outliers para análise posterior. Uma curadoria mais aprofundada mostrou que outliers podem ser identificados em genes associados às anomalias congênitas estruturais correspondentes em todos os quatro fetos afetados. Identificar os outliers fornece mais evidências no nível do RNA para ajudar no diagnóstico.

As descobertas deste estudo têm implicações significativas na resolução de doenças raras não diagnosticadas em Hong Kong. É a primeira vez que o sequenciamento de RNA de células do líquido amniótico é relatado para fornecer utilidade clínica potencial no diagnóstico pré-natal na literatura. Com a identificação da causa genética, é possível a medicina de precisão, como manejo clínico personalizado e diagnóstico genético pré-implantação para famílias com histórico familiar.

Este estudo foi selecionado como o ‘Reviewers’ Choice Abstract’ (top 10% do resumo do pôster) na Reunião Anual da Sociedade Americana de Genética Humana (ASHG) 2022, uma das maiores conferências do gênero, na qual cientistas de todo o mundo são selecionados para apresentar suas descobertas de pesquisa de ponta de forma colaborativa. ‘É uma honra para o pôster HKUMed ser selecionado e pontuado como o top 10% dos resumos de pôsteres nesta conferência internacional. A sequenciação de ARN tem um grande potencial na resolução de doenças genéticas inexplicáveis. Continuaremos a fortalecer os laços e colaborações com instituições em Hong Kong e no exterior, contribuir para a pesquisa científica internacional e trazer benefícios de volta aos nossos pacientes locais’, disse o Dr. Brian Chung Hon-yin, geneticista clínico, professor associado clínico, Departamento de Pediatria e Medicina do Adolescente, Escola de Medicina Clínica, HKUMed.

Anita Kan Sik-yau, Professora Associada Honorária do Departamento de Obstetrícia e Ginecologia, Escola de Medicina Clínica, HKUMed cum Vice-Diretora do Laboratório do Laboratório de Diagnóstico Pré-Natal do Hospital Tsan Yuk acrescentou: ‘Na ocasião memorável do Hospital Tsan Yuk (TYH ) do 100º aniversário, este estudo demonstrou o serviço excepcional da TYH para Hong Kong ao longo do século passado e o esforço contínuo para contribuir com todos os necessitados, juntamente com pesquisas inovadoras.’

Time de pesquisa

Esta pesquisa foi conduzida pelo Dr. Brian Chung Hon-yin, Professor Associado Clínico, Departamento de Pediatria e Medicina do Adolescente, Escola de Medicina Clínica, HKUMed; Dra. Anita Kan Sik-yau, Professora Associada Honorária, Departamento de Obstetrícia e Ginecologia, Escola de Medicina Clínica, HKUMed. Mianne Lee, candidato a MPhil, e Dra. Anna Kwong Ka-yee, Diretora Assistente de Pesquisa, Departamento de Pediatria e Medicina do Adolescente, Escola de Medicina Clínica, HKUMed são os primeiros autores.

Outros colaboradores incluíram o Dr. Christopher Mak Chun-yu, Martin Chui Man-chun, Jeffrey Chau Fong-ting, Departamento de Pediatria e Medicina do Adolescente, Escola de Medicina Clínica, HKUMed; Dr. Kelvin Chan Yuen-kwong, Dra. Sandy Au Leung-kuen e Lo Hei-man, Departamento de Obstetrícia e Ginecologia, Escola de Medicina Clínica, HKUMed. Os colaboradores internacionais foram o Professor Julien Gagneur e o Dr. Vicente A Yépez do Departamento de Informática, Universidade Técnica de Munique, Garching, Alemanha.

Este estudo foi apoiado pela Sociedade para o Socorro de Crianças Deficientes, Saúde e Fundo de Pesquisa Médica do Departamento de Saúde, o Governo da Região Administrativa Especial de Hong Kong e a Fundação Sr. e Sra. Edward CM Wong.