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Pintando uma imagem mais abrangente da atividade da droga analisando mais de um tipo de dados – Strong The One

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Um novo papel em Sistemas de Células explora a importância do uso de vários tipos de dados na descoberta de medicamentos. O artigo analisa mais de 1.000 medicamentos testados em seis doses e demonstra que a expressão gênica e a morfologia celular fornecem informações diferentes para a priorização de medicamentos.

Liderado pelo cientista de dados biomédicos Gregory Way, PhD, MS, o estudo mostra que, usando esses dois tipos de dados simultaneamente, os cientistas podem medir aspectos fundamentalmente diferentes da biologia da droga.

“Acreditamos que esses dois métodos populares podem ser usados ​​a nosso favor na concepção de medicamentos que abordam toda a complexidade da biologia”, disse Way, que é professor assistente de informática biomédica no Campus Médico Anschutz da Universidade do Colorado.

Way e uma equipe de cientistas de dados descobriram que os dois tipos de dados fornecem uma visão parcialmente compartilhada, mas também complementar, dos mecanismos de drogas. Eles disseram que o uso de ambas as abordagens pode avançar na descoberta de medicamentos, genômica funcional e medicina de precisão em direções únicas.

“Embora a rotulagem de medicamentos com base no mecanismo de ação seja incrivelmente poderosa, a abordagem corre o risco de perder uma imagem maior. Ambos os tipos de dados, coletados por meio de triagem fenotípica de medicamentos, abrangem a complexidade da biologia e podem permitir que os cientistas estudem e aproveitem os efeitos multifacetados que as drogas podem oferecer “, acrescenta Way.

Seu artigo mostra como os ensaios se comparam entre si em tarefas biológicas úteis (por exemplo, mecanismo de previsão de ação) dadas todas as fontes de variação/ruído e as melhores práticas atuais no processamento de dados. A abordagem de triagem de drogas fenotípicas permite que os pesquisadores meçam milhares de características de milhares de drogas diferentes em um único experimento.

“Esperamos que nossa análise possa orientar os pesquisadores no projeto experimental e na compreensão das limitações de sua modalidade de perfil particular para fornecer medições mais consistentes e maximizar o potencial de sucesso na descoberta de medicamentos”, disse Way.

O artigo orienta os cientistas no planejamento de experimentos que perfilam células para reverter fenótipos de doenças, quantificando a resposta celular a perturbações químicas ou genéticas e questionando mecanismos de drogas.

Fonte da história:

Materiais fornecidos por Campus Médico Anschutz da Universidade do Colorado. Original escrito por Julia Milzer. Nota: O conteúdo pode ser editado para estilo e duração.

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