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Segundo a OMS, a resistência aos antibióticos é uma das maiores ameaças à saúde pública. Os pesquisadores da DTU criaram uma nova ferramenta na luta contra bactérias resistentes que, com base em 214.000 amostras de microbioma, podem criar uma visão geral do problema entre países, pessoas e ambientes.
No futuro, mesmo uma pequena infecção pode se tornar uma ameaça à vida das pessoas se as bactérias causadoras de doenças se tornarem resistentes ao tratamento tradicional com antibióticos.
Com base em 214.000 amostras de microbiomas, os pesquisadores da DTU criaram uma plataforma de acesso livre que mostra onde no mundo diferentes tipos de bactérias resistentes são encontrados e em que quantidades.
Para entender como a resistência aos antibióticos está se espalhando pelo mundo, é importante saber onde, quais e quantos genes de resistência são encontrados em todos os ambientes que nos cercam. Os genes que fornecem resistência podem se espalhar entre animais, humanos e o meio ambiente.
Os dados podem ser usados para personalizar diretrizes
Hoje, há uma grande quantidade de dados disponíveis em vários repositórios online e um número limitado de conjuntos de dados sobre a ocorrência de bactérias resistentes em, por exemplo, esgoto, solo, animais ou humanos. Mas os dados não estão sendo usados ativamente, porque até agora tem sido difícil acessar, manipular e, especialmente, utilizar esses grandes conjuntos de dados devido ao poder de computação necessário.
“Essas grandes quantidades de dados são interessantes porque podemos encontrar novos padrões e conexões entre microorganismos causadores de doenças e resistência a antibióticos. Por exemplo, podemos ver que certos tipos de resistência a antibióticos têm prevalência muito diferente em diferentes partes do mundo. Esse conhecimento podemos usar para personalizar diretrizes sobre como combater a resistência em diferentes lugares do mundo, diz a estudante de doutorado Hannah-Marie Martiny, do DTU National Food Institute, que é uma das forças motrizes por trás do novo banco de dados.
Conexões entre bactérias e resistência
Pesquisadores do DTU National Food Institute analisaram 214.000 amostras de, entre outras coisas, animais, humanos e solo, e as organizaram de forma a permitir que outras pessoas as usassem. O objetivo é criar um catálogo de bactérias resistentes que abrange países, pessoas e ambientes.
“Você pode compará-lo com uma grande enciclopédia, como a Wikipedia, que coleta conhecimento de muitas fontes diferentes e o organiza de forma que todos possam acessá-lo. Da mesma forma, coletamos dados sobre resistência a antibióticos em bactérias e os compartilhamos com todos”, diz ela.
As 214.000 amostras juntas ocupam quase 300 terabytes e são necessários meses para analisá-las em um computador de alto desempenho.
“Ao realizar as análises iniciais de uso intensivo de recursos e disponibilizá-las a todos, oferecemos aos pesquisadores de todo o mundo melhores oportunidades para encontrar novas soluções que podem ajudar a reduzir a incidência de resistência a antibióticos. Isso está de acordo com os princípios sobre como tornar os dados úteis em Ciência Aberta e FAIR”, diz o professor do DTU National Food Institute Frank Møller Aarestrup, que é um dos pioneiros no monitoramento de resistência.
Monitoramento global em tempo real
O desenvolvimento de tipos de bactérias resistentes varia muito de país para país. Mas uma bactéria resistente no Egito, por exemplo, pode se espalhar rapidamente pelo mundo e causar infecções em pacientes dinamarqueses com bactérias resistentes ao tratamento tradicional.
“As experiências da pandemia de Covid19 nos mostraram o valor dos dados de vigilância global, por exemplo, para combater doenças quando ameaçam se espalhar além das fronteiras de um país”, diz Frank Møller Aarestrup.
O trabalho para desenvolver o banco de dados está descrito no artigo científico “A curadoria de dados de 214K metagenomas para caracterização do resistome antimicrobiano global”, publicado na revista Biologia PLOS
O projeto é apoiado pela Fundação Novo Nordisk e faz parte do Observatório Versátil de Doenças Infecciosas Emergentes (VEO), que recebeu apoio do programa de pesquisa e inovação Horizonte 2020 da UE. O grupo de pesquisa para Epidemiologia Genética realiza pesquisas direcionadas com o objetivo de prever e prevenir doenças infecciosas entre humanos e animais, bem como apoiar a detecção e controle global com foco particular na resistência a antibióticos.
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