.
Um consórcio internacional de cientistas, liderado por Jeff Kidd, Ph.D. da Universidade de Michigan, Jennifer RS Meadows da Universidade de Uppsala, na Suécia, e Elaine A. Ostrander, Ph.D. do Instituto Nacional de Pesquisa do Genoma Humano do NIH, está usando um grande banco de dados de DNA canino sem precedentes para dar uma olhada imparcial em como nossos amigos peludos evoluíram para as várias raças que conhecemos e amamos.
Um novo artigo, publicado na revista Biologia do Genomadescreve o que o projeto Dog10K descobriu após sequenciar os genomas de cerca de 2.000 amostras de 321 cães de raças diferentes, cães selvagens, coiotes e lobos, e compará-los com uma amostra de referência – a de um pastor alemão chamado Mischka.
Analisando mais de 48 milhões de informações genéticas, eles descobriram que cada raça de cão tinha cerca de 3 milhões de diferenças de polimorfismo de nucleotídeo único. Esses SNPs ou “recortes” são os responsáveis pela maior parte da variação genética entre pessoas e cães. Eles também encontraram 26 mil sequências deletadas que estavam presentes no pastor alemão, mas não na raça de comparação, e 14 mil que estavam na raça comparada, mas faltando no DNA de Mischka.
“Fizemos uma análise para ver o quão semelhantes os cães eram entre si e descobrimos que poderíamos dividi-los em cerca de 25 grupos principais que correspondem praticamente ao que as pessoas esperariam com base na origem da raça, no tipo de cão. , tamanho e coloração”, disse Kidd, professor de Genética Humana e Medicina Computacional e Bioinformática na Faculdade de Medicina da UM.
A maioria dos genes variados, acrescentou ele, tinha a ver com a morfologia, confirmando que as diferenças de raça eram motivadas pela aparência dos cães.
Em relação aos cães, os lobos tiveram cerca de 14% mais variação. E os cães selvagens de aldeia – cães que vivem entre pessoas em aldeias ou cidades, mas não são mantidos como animais de estimação – exibiram mais variação genética do que os cães de raça.
O conjunto de dados, que foi processado usando o cluster de computação de alto desempenho dos Grandes Lagos na UM, também revelou uma quantidade incomum de retrogenes, um novo gene que se forma quando o RNA é transformado novamente em DNA e inserido de volta no genoma em um local diferente. O estudo encontrou 926 retrogenes, o mais famoso dos quais, diz Kidd, é um retrogene chamado FGF4o que resulta no fenótipo de perna curta visto em dachshunds e corgis.
“Os cães tendem a ter uma quantidade maior de retrogenes que resultaram em mutações selecionadas, que talvez as pessoas achassem fofas e criassem mais”, disse Kidd. Seu laboratório está tentando descobrir por que retrogenes e inserções acontecem com tanta frequência em cães.
Um dos benefícios do consórcio Dog10K é o seu tamanho, que permitirá aos investigadores da UM e de outros locais examinar as bases genéticas de outras características caninas e até de doenças comuns em cães, como o cancro.
.
