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Cientista encontra pistas em dados descartados que colocam a pesquisa no caminho certo – Strong The One

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Visitas regulares ao dentista também podem ajudar a manter a dor nas articulações sob controle.

Quando a bióloga computacional da Rice University, Vicky Yao, encontrou vestígios de bactérias associadas à doença periodontal em amostras coletadas de pacientes com artrite reumatóide, ela não tinha certeza do que fazer com isso.

Sua descoberta ajudou a desencadear uma série de experimentos que confirmaram uma conexão entre surtos de artrite e periodontite. O estudo é publicado em Ciência Medicina Translacional.

Rastrear essa conexão entre as duas condições pode ajudar a desenvolver terapias para artrite reumatóide, uma doença inflamatória autoimune que ataca o revestimento das articulações e pode causar problemas cardíacos, pulmonares e oculares. A abordagem que levou ao estudo pode ser frutífera em outros contextos de doenças, como o câncer.

“Os dados coletados em experimentos de organismos vivos ou células ou tecidos cultivados em placas de Petri são realmente importantes para confirmar hipóteses, mas, ao mesmo tempo, esses dados talvez contenham mais informações do que podemos derivar imediatamente”, disse Yao.

O palpite de Yao foi confirmado quando ela examinou mais profundamente os dados coletados de pacientes com artrite reumatóide por Dana Orange, professora associada de investigação clínica e reumatologista, e Bob Darnell, professor e médico assistente da Rockefeller University e do Howard Hughes Medical Institute.

Yao estava colaborando com Orange e outros em um projeto diferente que rastreou mudanças na expressão gênica durante surtos de artrite reumatóide.

“Orange, trabalhando com Darnell, coletou dados de pacientes com artrite em intervalos regulares enquanto, ao mesmo tempo, monitorava quando as crises aconteciam”, disse Yao. “A ideia era que, talvez olhando para esses dados retroativamente, algum padrão se tornasse visível, dando pistas sobre o que poderia causar o surto de artrite.

“Enquanto eu estava trabalhando naquele projeto, fui a uma palestra que achei muito legal porque apontou que nos dados que são ignorados ou jogados fora, você pode realmente encontrar vestígios de micróbios. Você está olhando para um ser humano amostra, mas você obtém um instantâneo dos micróbios flutuando. Fiquei intrigado com isso.”

Quando ela investigou, Yao descobriu que os germes nas amostras que mudavam consistentemente entre os pacientes antes das crises eram em grande parte aqueles associados à doença gengival.

“Eu estava curioso sobre esta ferramenta que permitia detectar micróbios em amostras humanas. Era como se, de graça, você tivesse uma perspectiva extra sobre os dados”, disse Yao. “Na época, eu não tinha trabalhado muito com dados microbianos. Desde então, Dana aproveitou todo esse conhecimento e se reuniu com pessoas que estudam essas bactérias.

“Uma das coisas que surgiram quando estávamos discutindo isso foi, quão legal seria se você pudesse prescrever algum tipo de enxaguatório bucal para ajudar a prevenir crises de artrite reumatóide.”

O foco de Yao desde que ingressou na Rice em 2019 mudou para a pesquisa do câncer. A descoberta de informações significativas em dados que normalmente seriam ignorados ou descartados inspirou Yao a adotar uma abordagem semelhante ao analisar dados de pacientes com câncer.

“Fiquei realmente interessado no que mais podemos encontrar na mineração de assinaturas microbianas em amostras humanas”, disse Yao. “Agora, estamos fazendo algo semelhante ao analisar o câncer.

“A esperança aqui é que, se encontrarmos algumas assinaturas microbianas ou virais interessantes associadas ao câncer, possamos identificar direções experimentais produtivas a seguir. Por exemplo, se ter um tumor cria esse viveiro de micróbios específicos que reconhecemos, então podemos pode talvez usar esse conhecimento como um meio de diagnosticar o câncer mais cedo ou de forma menos invasiva ou dispendiosa. Ou, se você tiver micróbios que tenham uma associação muito forte com as taxas de sobrevivência, isso pode ajudar no prognóstico. E se os experimentos confirmarem um causal ligação entre um vírus ou bactéria específica e um tipo de câncer, então, é claro, isso pode ser útil para a terapêutica.”

Um dos exemplos mais conhecidos de patógeno associado ao câncer é o papilomavírus humano (HPV). Yao usou essa conexão bem documentada para verificar sua abordagem.

“Quando fizemos o mesmo exercício observando amostras de tumores de câncer cervical, detectamos consistentemente o vírus”, disse ela. “É uma boa descoberta de prova de princípio que mostra que a presença de patógenos específicos pode ser significativa para certos tipos de câncer.

“Estou realmente interessado em usar abordagens computacionais para preencher a lacuna entre os dados experimentais disponíveis e as formas de interpretá-los. A análise computacional é uma maneira de ajudar a interpretar os dados e priorizar as hipóteses para os clínicos ou cientistas experimentais testarem.”

National Institutes of Health (R01 AR063676, R01 AR078268, U19 AI110491, U01 AI101981, T32 HG003284, R01 GM071966, T32 AI007290-35, P30 AR079369), National Science Foundation Graduate Research Fellowship, Robertson Foundation, Rockefeller University (UL16 TR0018 ), a Bernard and Irene Schwartz Foundation, a Iris and Jungming Le Foundation, Rockefeller Clinical and Translational Science Award Program Pilot Award, a Rheumatology Research Foundation e o National Cancer Institute (F30 CA243480) apoiaram a pesquisa.

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