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Uma infinidade de novos dados de sequência genômica preenche grandes lacunas na árvore da vida da mosca-das-frutas, relatam Bernard Kim da Universidade de Stanford, EUA, e colegas no periódico de acesso aberto Biologia PLOSpublicado em 18 de julho.
As moscas-das-frutas são organismos modelo clássicos em pesquisa biológica e estavam entre as primeiras espécies a ter seu genoma inteiro sequenciado. Com mais de 4.400 espécies, a diversidade da família das moscas-das-frutas pode oferecer insights sobre padrões e processos evolutivos. Mas apenas uma fração dessas espécies tem seu genoma sequenciado, e a maioria das sequências de genoma de moscas-das-frutas publicadas são de um conjunto muito limitado de espécies com linhagens de laboratório consanguíneas representativas.
Para abordar isso, os pesquisadores sequenciaram os genomas de 179 espécies de moscas da família Drosophilidae, incluindo moscas capturadas na natureza, espécimes preservados de museus e linhagens criadas em laboratório. Usando uma abordagem de sequenciamento híbrido que combina as mais novas tecnologias de sequenciamento de leitura curta e longa, eles conseguiram produzir sequências de genoma de baixo custo e alta qualidade a partir de material limitado. Eles usaram as novas sequências de genoma e dados publicados anteriormente para produzir uma árvore filogenética para 360 espécies da família Drosophilidae, refinando nossa compreensão das relações evolutivas dessas espécies. Eles também alinharam quase 300 genomas de moscas-das-frutas como uma ferramenta de código aberto para futuras pesquisas genômicas comparativas, como um alinhamento de genoma completo.
Embora os esforços de sequenciamento em larga escala para organismos maiores, como mamíferos, estejam bem encaminhados, este estudo demonstra que o sequenciamento do genoma para organismos pequenos, como moscas individuais — mesmo aquelas preservadas em museus por até duas décadas — agora é possível.
Os autores acrescentam: “Agora é inteiramente viável pensar em montar genomas para centenas ou milhares de espécies, mesmo com o orçamento de pesquisa de um único laboratório. Esse tipo de amostragem em larga escala, em nível de clado, nos fornecerá um nível de resolução sem precedentes para estudar as sequências do genoma de grupos diversos, como moscas-das-frutas e além, o que certamente melhorará nossa compreensão do processo evolutivo.”
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