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Com o surgimento contínuo de novas variantes e o risco de novas cepas do vírus, o desenvolvimento de terapias inovadoras contra o SARS-CoV-2 continua sendo um grande desafio de saúde pública. Atualmente, as proteínas que estão na superfície do vírus e/ou estão envolvidas na sua replicação são os alvos terapêuticos preferenciais, como a proteína Spike alvo das vacinas. Uma delas, a proteína não estrutural Nsp1, havia sido pouco estudada até então. Uma equipa da Universidade de Genebra (UNIGE), em colaboração com a University College London (UCL) e a Universidade de Barcelona, revelou agora a existência de um ”bolso” oculto na sua superfície. Alvo potencial de medicamentos, essa cavidade abre caminho para o desenvolvimento de novos tratamentos contra a Covid-19 e outros coronavírus. Esses resultados podem ser encontrados na revista eLife.
O rápido lançamento de novas vacinas e medicamentos antivirais ajudou a conter a pandemia de Covid-19, causada pelo vírus SARS-CoV-2. Apesar dos progressos registados, o desenvolvimento de novas terapêuticas continua a ser uma prioridade urgente: o aparecimento contínuo de novas variantes – algumas das quais resistentes aos tratamentos actuais – e o possível aparecimento de novas estirpes do vírus representam um risco de novas pandemias . As proteínas estão na vanguarda dos alvos terapêuticos para combater o vírus. A mais conhecida é a proteína Spike, que está localizada na superfície do SARS-CoV-2 e lhe dá a aparência de “espinhos”. É a chave para o vírus entrar em nossas células. É o alvo das vacinas de RNA mensageiro.
Uma proteína-chave pouco estudada
O SARS-CoV-2 também produz outras proteínas – as proteínas “não estruturais” – usando os recursos de nossas células depois de entrar nelas. Há dezesseis deles. Eles são essenciais para a replicação do vírus. Alguns foram estudados no contexto do desenvolvimento de novos medicamentos. Outros receberam menos atenção. É o caso da proteína Nsp1. Sem cavidades óbvias em sua superfície para ancorar uma droga em potencial, os pesquisadores sentiram que não poderia ser um alvo para tratamento.
”Nsp1 é, no entanto, um importante agente infeccioso do SARS-CoV-2”, explica Francesco Luigi Gervasio, professor titular da Seção de Ciências Farmacêuticas e do Instituto de Ciências Farmacêuticas da Suíça Ocidental da Faculdade de Ciências da UNIGE, e no Departamento de Química e no Instituto de Biologia Molecular e Estrutural da UCL. “Essa pequena proteína viral bloqueia seletivamente os ribossomos – as fábricas de proteínas de nossas células – tornando-os inutilizáveis por nossas células e, assim, impedindo a resposta imune. Ao mesmo tempo, via ribossomos, Nsp1 estimula a produção de proteínas virais.”
Revelado por algoritmos
A equipe do professor Gervasio, em colaboração com a UCL e a Universidade de Barcelona, revelou a existência de uma cavidade ”oculta” na superfície do Nsp1, que pode ser o alvo de futuros medicamentos contra o SARS-CoV-2. ”Para descobrir esse bolso enigmático e parcialmente oculto, realizamos simulações usando algoritmos que desenvolvemos”, explica Alberto Borsatto, pesquisador e assistente de ensino na Seção de Ciências Farmacêuticas e no Instituto de Ciências Farmacêuticas da Suíça Ocidental da Faculdade de Ciências da UNIGE, primeira autora do estudo. ”Então, a fim de confirmar que esta bolsa poderia ser usada como alvo de drogas, usamos triagem experimental e técnicas de cristalografia de raios-X.”
A equipe de pesquisa testou muitas moléculas pequenas que poderiam se ligar à cavidade Nsp1 (triagem experimental). Ele identificou um em particular – 5 acetilaminoindano ou 2E10 – que também permitiu determinar o arranjo espacial dos átomos que compõem a cavidade (por cristalografia). Esses são dados essenciais que formam a base para o desenvolvimento de novos medicamentos.
“Esses resultados abrem caminho para o desenvolvimento de novos tratamentos direcionados à proteína Nsp1, não apenas contra o SARS-CoV-2 e suas variantes, mas também contra outros coronavírus nos quais o Nsp1 está presente”, disse Francesco Luigi Gervasio, o último do estudo. autor. Já o método desenvolvido para revelar o bolsão oculto do Nsp1 pode ser usado para descobrir, na superfície de outras proteínas, novas cavidades ainda desconhecidas dos cientistas.
Fonte da história:
Materiais fornecidos por Université de Genève. Observação: o conteúdo pode ser editado quanto ao estilo e tamanho.
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