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Muitas das respostas para responder efetivamente a um patógeno estão em seu genoma. Compreender o código genético de um patógeno como o Ebola ou o vírus que causa o COVID-19 permite que os cientistas rastreiem seu movimento, prevejam o comportamento futuro, identifiquem a origem do surto e, o mais importante, desenvolvam vacinas e tratamentos eficazes. Essa tecnologia foi crítica durante a pandemia e será ainda mais em surtos futuros.
Isso torna o desenvolvimento contínuo do sequenciamento genômico uma das conclusões mais importantes da pandemia, argumentam os biólogos Jason Ladner e Jason Sahl em um ensaio publicado em PLOS Biologia. O sequenciamento genômico teve um enorme impacto na resposta global ao COVID-19, e a tecnologia melhorou à medida que mais pesquisadores a colocaram em uso. Para responder melhor à próxima pandemia, precisamos desenvolver esse conhecimento, escrevem eles, ao mesmo tempo em que reconhecemos as lacunas em nossas capacidades que permanecem.
“A pandemia do COVID-19 representou, de muitas maneiras, o ponto culminante do sequenciamento e da análise que vinha sendo construído há anos”, disse Sahl. “Queríamos destacar que, embora o interesse pela pandemia tenha diminuído, outras ameaças ainda existem, e manter nosso ímpeto ao mesmo tempo em que construímos uma nova infraestrutura será vital para melhorar as respostas de saúde pública às ameaças existentes e emergentes”.
Por que a história é importante para o presente e o futuro
Ladner e Sahl, professores associados do Departamento de Ciências Biológicas da Northern Arizona University, e seus colegas do Pathogen & Microbiome Institute, estão na linha de frente da aplicação e análise de tecnologia genômica de ponta no estudo de patógenos e trabalharam com vários agentes infecciosos, incluindo Ebola, Zika, Yersinia pestis (que causa a peste), antraz e Burkholderia pseudomallei (que causa a melioidose).
No ensaio, eles se concentram na história dos patógenos e no sequenciamento genômico para ajudar os leitores a entender que os padrões que vemos agora não são novos. Na década de 1960, os cientistas pensavam que tinham doenças infecciosas resolvidas com o desenvolvimento de vacinas, antibióticos, higiene pessoal e normas sanitárias e muito mais.
“O que não apreciamos totalmente na época, no entanto, foi a incrível diversidade de patógenos humanos, sua capacidade de evolução rápida e a natureza dinâmica das interações entre patógenos e seus hospedeiros”, escrevem Ladner e Sahl. “Combinados, esses fatores complicaram substancialmente nossas tentativas de mitigar os impactos das doenças infecciosas”.
Sessenta anos depois, os patógenos continuam complicados. Os biólogos fornecem um roteiro para várias partes interessadas na preparação para a próxima pandemia: destacando os déficits de pesquisa para os cientistas abordarem; apontando a necessidade crítica de colaboração e investimento para os formuladores de políticas; e explicando a história do sequenciamento genômico de patógenos para autoridades de saúde pública, mídia, filantropos e outros, para que possam entender todo o potencial do sequenciamento de patógenos para a saúde pública.
“Escrevemos este ensaio para contribuir para uma discussão mais ampla de como o sequenciamento do genoma do patógeno deve ser usado no futuro para melhorar a saúde pública e que tipos de investimentos e inovações precisamos para facilitar isso”, disse Ladner. “Este não é mais um tópico de nicho, mas com amplo apelo para cientistas em vários campos diferentes, funcionários que estabelecem políticas de saúde e mídia que estão trabalhando para entender os avanços recentes e comunicá-los ao público em geral”.
Lições aprendidas com a pandemia de COVID-19
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Precisamos de uma infraestrutura melhor. O maior déficit é a falta de infraestrutura global para dar suporte ao sequenciamento em tempo real e à colaboração entre países e entre diferentes instituições de pesquisa. Parte disso foi construído durante a pandemia, mas os cientistas também identificaram déficits na capacidade de sequenciamento e compartilhamento de dados, o que significa que estão trabalhando com uma imagem incompleta do que está acontecendo no terreno. Isso exigirá investimentos sustentados entre as partes interessadas.
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Precisamos expandir a maneira como usamos genomas de patógenos em nossa resposta a doenças infecciosas. Este é um problema de ciência, mas também é muito maior do que isso. “Para realizar todo o potencial de saúde pública do sequenciamento de patógenos no futuro, precisamos aproveitar o momento gerado pela pandemia do COVID-19, garantindo que os benefícios de investimentos futuros se apliquem amplamente a todo o espectro de doenças infecciosas humanas”, disse Ladner .
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Precisamos definir objetivos para o papel da genômica de patógenos na resposta às ameaças à saúde pública. Com o COVID, os cientistas usaram os genomas da melhor maneira possível, mas, na maioria dos casos, não tinham objetivos claros sobre como os genomas deveriam contribuir para uma resposta de saúde pública. A definição desses objetivos ajudará os pesquisadores a planejar futuros surtos e avaliar a eficácia da resposta.
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Temos que manter o ritmo. Embora o COVID-19 continue sendo uma ameaça, o interesse pela pandemia diminuiu. No entanto, a resistência antimicrobiana ainda representa uma ameaça significativa à saúde pública. A infraestrutura de sequenciamento construída durante a pandemia precisará ser apoiada por investimentos federais sustentados, ou a sociedade retornará à capacidade pré-pandêmica e será incapaz de responder rapidamente à próxima ameaça à saúde pública, disse Sahl.
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