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Depois de décadas de resultados contraditórios, a árvore filogenética das aves foi finalmente revelada em colaboração com o investigador do Centro Interdisciplinar de Investigação Marinha e Ambiental (CIIMAR) e professor da Faculdade de Ciências da Universidade do Porto (FCUP), Agostino Antunes.
Foi o poder da genómica comparativa combinado com os mais recentes métodos computacionais e de supercomputação que permitiu a investigação de grandes quantidades de dados genómicos com grande precisão e velocidade e lançou as bases para a construção da árvore genealógica de aves mais abrangente de sempre.
Muitos estudos anteriores tentaram construir uma árvore filogenética para aves usando pequenos conjuntos de dados de diferentes regiões genômicas. No entanto, estas ações produzem frequentemente resultados contraditórios.
O estudo “A complexidade da evolução das aves revelada pelos genomas de nível familiar”, publicado na revista Nature e envolvendo o investigador do CIIMAR e professor da FCUP Agostinho Antunes, tornou possível utilizar pela primeira vez dados completos do genoma para construir aves . Árvore para espécies de pássaros. Uma reconstrução complexa que mostra 93 milhões de anos de relações evolutivas entre 363 espécies de aves, representando 92% de todas as famílias de aves.
Segundo Agostinho Antunes, citado em comunicado, “esta nova árvore genealógica será uma base sólida para mapear a história evolutiva de todas as espécies de aves, com implicações importantes para a investigação de aves, estudos de biodiversidade e conservação”.
Este conjunto completo de dados genómicos foi produzido pelo consórcio B10K (Bird 10,000 Genomes Project) após sequenciação de 48 genomas aviários publicado em 2014 na revista Science, que envolveu também uma colaboração entre um investigador do CIIMAR e um professor da FCUP. O trabalho agora publicado traz avanços significativos em relação aos trabalhos anteriores.
Dados cada vez mais completos
Utilizando dados completos do genoma de 363 espécies de aves, o estudo publicado inclui agora o maior conjunto de dados já utilizado em análises evolutivas de aves. Para conseguir isso, a equipe B10K construiu um novo pipeline para extrair mais de 150.000 regiões espalhadas por todo o genoma. A caracterização das relações evolutivas ao longo do genoma permitiu-nos identificar padrões associados ao contexto genómico e às propriedades da sequência.
Agostino Antunes explica como isto distingue este estudo de tentativas anteriores: “Diferentes partes do genoma, por exemplo, cromossomas individuais ou genes codificadores de proteínas, suportam frequentemente árvores muito diferentes. Isto provavelmente explica porque é que estudos anteriores, que analisaram apenas certas partes do genoma. .
O grupo de trabalho concluiu que, para a maioria dos grupos, é possível chegar a um consenso sobre as suas relações quando é utilizada uma quantidade suficiente de dados. Mas as posições evolutivas de alguns grupos de aves, como as corujas ou os falcões, continuam interessantes, mesmo com dados completos do genoma. Nestes casos, a recolha de grandes quantidades de dados de alta qualidade é essencial para produzir uma árvore filogenética robusta.
Esta nova árvore genealógica resolve alguns destes debates de longa data sobre as relações entre espécies de aves e estabelece uma base sólida para o estudo da evolução das aves e da evolução das suas características, abrindo novas perspectivas sobre o que ainda é um longo caminho para a compreensão completa do mistérios dos pássaros. desenvolvimento.
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